Op het tweede onderdeel van het voorstel kwam veel kritiek. Een aantal kleine landen was bang dat de voorzitter van de Raad van Ministers te veel als een soort Europese president zou gaan optreden. De voorzitter van de Raad van Ministers zou de voorzitter van de Europese Commissie overvleugelen. Premier Balkenende keerde zich tegen het Frans-Duitse voorstel: "Er komen dus twee kapiteins op een schip. De voorzitter van de Europese Raad en de voorzitter van de Europese Commissie. Als zeevarende natie weten we dat zoiets niet werkt." (de Volkskrant van 4 februari 2003).
Naast bovenstaande kritiek op het voorstel speelde bij de Nederlandse regering ook de angst mee dat het kiezen van een voorzitter van de Raad van Ministers zou leiden tot een verzwakking van de relatieve machtspositie van Nederland in Europa. Nederland keerde zich dan ook vooral tegen het tweede onderdeel van het Frans-Duitse voorstel.
Leg uit dat de machtspositie van Nederland wordt aangetast als het tweede onderdeel van het Frans-Duitse voorstel zou worden uitgevoerd.